Nell'immagine è riportato uno screenshot della schermata principale di SpyBot Search & Destroy in modalità "avanzata" da dove è possibile accedere, oltre che alle funzionalità classiche, a funzioni e caratteristiche avanzate del programma.
Da questa schermata è infatti possibile accedere alle pianificazioni di scansione del sistema da programmare come si preferisce o come si ritiene più opportuno. SpyBot Search & Destroy è anche dotato della funzione di "wiping" per la cancellazione definitiva e senza possibilità di recupero di file privati e segreti.
Sempre da questa finestra è possibile accedere al file di avvio delle applicazioni del Windows e modificarne il contenuto.